カスタム Applicationクラスにて独自の Configuration(asset内のファイルを参照する読み込み専用)を setDefaultConfigurationしていて、るのだけど、ContentProviderから getInstanceを呼び出すとそれが無視されてしまう感じ。
最終的に実行ファイルのスキーマやらバージョンやらが asset内のファイルのそれと合っていなかった模様。
ちなみに assetFileというメソッドは asset内のファイルを直接使うのではなく nameで指定したファイル(未指定なら default.realm)にコピーするメソッドだった模様。